Refugium je volitelná součást filtrace mořského akvária. Většinou je umístěno v sumpu jako zvláštní komora. Jeho funkce je založena na podpoře růstu vybraných druhů řas, které odebírají z vody živiny, a tím zajišťují odbourávání dusíkatých látek. Pro správnou funkci je potřeba zajistit vhodné osvětlení a také proudění vody. Refugium může fungovat i jako uzavřená nádoba, kterou proudí voda a světlo je zajištěno skrze stěny nádoby. V tom případě je označeno spíše jako řasový reaktor. Kromě odbourávání dusíkatých látek z nádrže dokáže přítomnost vybraných druhů řas také omezit přítomnost nechtěných řas v hlavní nádrži.

Refugium je také výborným prostředkem pro zvýšení populace živého krmení v podobě Amphipodů, Copepodů a Isopodů v nádrži. Díky oddělenému prostoru se populace těchto užitečných živočichů může bez problémů množit, což přináší benefit celé nádrži. Nejčastěji využívanými řasami do refugia jsou Chaetomorpha, Caulerpa a nebo červená Glacilaria. Zvolením vhodných řas může refugium vypadat i dekorativně, přestože to není jeho primární funkcí.